Полевые исследования сотрудники научного отдела проводят согласно утвержденным на Ученом совете планам научно-исследовательской работы. Особенность научной работы в заповедниках – это возможность проведения длительных многолетних исследований на его территории. Одной из таких тем является комплексное почвенно-геоботаническое изучение процессов восстановления высокогорных лугов Лагонакского нагорья после прекращения массового выпаса домашних животных.
Научные сотрудники Кавказского заповедника исследовали растительность Лагонакского нагорья. Внимание ученых направлено на распространение вейника тростникового и его доминирование над другими растительными сообществами субальпики.