Присутствие арктических растений во флоре заповедника связано с их миграцией во время последнего ледникового периода.
На территории заповедника не представлено всё многообразие лесных сообществ Западного Кавказа.
Представители колхидского подлеска пережили ледниковый период в горах под снеговым покровом.
Самые крупные массивы пихты Нордмана сохранились в России на территории заповедника.
Ненарушенные растительные сообщества заповедника устойчивы к проникновению чужеродных видов.
На южных склонах некоторых районов заповедника сохранились степные участки с ковылем перистым.
На высокогорных лугах встречается многолетний злак – рожь Куприянова, вероятно, дикий предок культурных рожей.
В западной части заповедника верхнюю полосу леса составляют не березы, а буки и рябины.